《随时候命 下部》讲述了香港飞行服务队（GFS）二级空勤主任高可风（郑伊健）和一级机师叶青云（林保怡）合作无间，前者负责拯救，后者负责驾驶。GFS新一届的学员顺利诞生，风、云分别负责三级空勤主任施楚淇（钟嘉欣），及见习机师蒋加诺（黎诺懿）的训练工作。淇和诺于面对严格的训练的同时，又要面对家庭及爱情的考验；两位阅历尚浅的年轻人能否咬紧牙关，坚持下去？
另一方面，经历过无数惊险场面的风和云在面对人生的挑战时，却亦有欣弱的时候：风女友康友岚（佘诗曼）失忆后虽然重新接受他，然而他热心助人的性格，却令岚感到被冷落，转而与云走在一起，几位随时候命上山下海拯救生命的飞行服务队员，又将以什么态度面对人生的考验。
