《特殊高地》讲述长白山某林区发生森林大火，武警部队某部马踏湖大队大队长姜孟华带领部队立刻扑入火场。刚从森警指挥学院毕业的中队长齐大川，带领两个留守战士抄近路，率先赶到了被大火威胁的榆树沟军用弹药库为了保住弹药库，齐大川和副县长马春风发生冲突，齐大川“骗”走马春风，果断采取以火攻火的战术，使弹药库和上千名群众生命安然无恙。
齐大川在扑火战斗中发现了部队存在的问题，他雄心勃勃，要建设一支高水平，高素质，高科技的森警队伍大队长姜孟华是一位德高望重的老森警，他从心里喜欢齐大川的闯劲，但对他的一些做法又不能接受 两个个性极强的军人之间，总是磕磕碰碰，矛盾不断。
在扑火战斗中，齐大川救了林业局女大学生叶斯芳，此后叶斯芳处处给齐大川带来“麻烦”家乡的姑娘柳絮来看望齐大川，两个姑娘对大川的爱慕，使大川更感到“麻烦”。
新战士牛得水为了让家乡也长出北方的松树，违反森警的纪律，偷着往家里寄松树籽，齐大川命令他把松籽送回森林。牛得水在森林中迷路，被盗猎者的套子套住，悬在空中。齐大川在寻找牛得水的路上．发现了受伤的盗猎者草粑子，齐大川救了草粑子，草粑子在医院逃走。
草粑子的妹妹吴玄贿赂副教导员罗雨新，罗雨新虽然拒绝了贿赂，但因为价格便宜，还是购买了吴玄的化学灭火弹。大演习中，因罗雨新购买的化学灭火弹不合格，新战士小棒棰不幸牺牲。罗雨新追悔莫及。罗新雨发现了吴玄的行踪，在抓捕吴弦时，被草粑子打昏。
姜孟华胃病转为胃癌，关键时刻，他唯一的儿子因车祸死亡，姜孟华几乎崩溃，但面对自己的部队，面对大森林，他终于挺了过来，决心为部队工作到生命最后一刻。
草粑子和吴玄在林中盗猎引起火灾，姜孟华、齐大川、牛得水、叶斯芳、柳絮，以及所有森警官兵和林业职工都冲入火场。经过一场奋战，这场山火很快就被扑灭了，逃跑中的草粑子和吴玄也被罗雨新抓获……
