《神奇宝贝宠物小精灵危险的迷宫篇》讲述了小智为了要成为一流的小魔怪指导员，而必须踏上修行的旅程接受考验。不料出发的当天，小智却因睡懒觉而误了时间，比其他人晚了一步。好不容易从博士那里领来没有要的“皮卡丘”，谁知“皮卡丘”却难以照料又特别固执。
01 熊宝宝的秘密
02 结冰的向日种子之密
03 果然翁遇难了
04 小刚病倒了－危险的露营
05 大力鳄抵抗水简龟－相扑大战斗
06 与神奇宝贝讲话－神奇宝贝的语言－神奇宝贝的心情
07 大嘴蝠对抗假面女王武藏遗迹之战斗
08 图图犬的奇迹旭日中的光辉
09 尼多力诺与尼多娜－小刚的玫瑰色生活
10 再见了菊草叶，电气的迷宫
11 神奇宝贝气球大赛越过暴风雨
12 迷唇娃娃死人超级巨星喜欢神奇宝贝
13 踏浪追踪铁甲暴龙！湖之站！
14 变隐龙在哪里？看不见的神奇宝贝，大混乱
15 讨厌水系神奇宝贝的乔伊小姐，小霞的愤怒
16 圣母大奶罐，沙漠的秘密
17 光辉灯塔！浅葱市的战斗
18 湛蓝道馆，正面决斗，格斗大对决
19 旋涡列岛，新的挑战
20 波波与大波波，飞向未曾见过的天空
