《机动战士Z高达2:恋人们》讲述了宇宙世纪0087年，一场内战在地球联邦军队的精英组织“提坦斯”和反地球联邦组织“奥干”之间持续着。为了给实施计划提供补给，卡缪来了香港，在这里他和一个名叫凤的神秘少女有了命运的相遇。但是，凤是一个被提坦斯进行人工NEW TYPE化的“新人类”，这一禁忌的相遇使卡缪在纠结着爱情与战争的苦恼中饱受折磨。经历了一场壮绝的战斗后，凤带着必死的觉悟将卡缪送往宇宙。
然而，重返宇宙的卡缪，面前是更加激烈的战场和一架新型的“MSZ高达”。提坦斯更采取残忍的集群陷阱作战方针，并向月面城市投放炸弹，使战局日趋严峻。与此同时，双方的政治局势也开始发生重大转折：在奥干，暗杀领导人布雷克斯准将的行动失败，而从木星归来的提坦斯指挥官西罗克也在慢慢扩大自己的势力范围……
接着，第三方势力——旧吉恩军队的余党阿克西斯终于开始有所行动了……爱恨交织的命运战歌奏响，卡缪的新力量“Z高达”，撕裂了混迷的战场，直上云霄。
