《凤凰大视野尘封往事:民国疑案》讲述民国时期暗杀不断、悬案迭出、扑朔迷离，给那段历史留下了许多至今仍无法破解的谜团。那是一个民族危亡的时刻，那是一个风雨缥缈的国家，此时的中国俨如酣睡的雄狮，成为世界猎人们纷纷关注的目标。你方唱罢我登场，各种势力在中国的各个领域明争暗斗，似乎每一个角落都是纷纷扰扰，无有静时。这段短暂而动荡的历史，给我们留下了许多无法破解的谜团。
第1集：地狱之门
汪精卫之死是一个莫大的疑案。关于他的死有数家言，都莫衷一是。他复杂多变荣辱并存的一生也同样让我们充满了各种疑惑。
第2集：枭雄之死
吴佩孚是民国初期的风云人物，他支持五四运动，和苏俄的关系密切，而且还支持工人成立工会，后来又成为北伐的对象。可以说他的每一次个人选择，都牵连着中国政治更迭的方向，甚至包括他的死亡。直到现在关于吴佩孚的死因都没有一个肯定的结论。
第3集：谍海浮觉
1946年3月17日下午四点，毛人凤收到了李崇诗的密电，戴笠和他的专机神秘失踪了。戴笠和他的组织制造了很多神秘，同时他们也带走了很多疑问。连戴笠的死都变得那么讳莫如深、扑朔迷离。
第4集：星坠南海
在抗日战争胜利之后，出版了一本书《陨落的晨星》，讲述的是战争当中牺牲的那些中国文化人的故事。而其中最令人扼腕叹息的莫过于著名文学家郁达夫，他是这场战争中最后一位陨落的文化名人。
第5集：遗骨迷踪
上世纪二十年代开始，中外科学家在北京附近的周口店龙骨山上日复一日地苦苦寻找了十多年，终于震惊世界，他们发现了当时世界上最早的人类化石——北京人头盖骨化石。但是在1941年，日军占领北平期间，保存在协和医院的北京人头盖骨化石却突然神秘失踪了。此后半个世纪，它一直下落不明。直到1996年6月，中国科学院从一个日本老兵的遗言里才得知了北京人头盖骨的点滴线索。
下部：铁血恩仇一桂系军阀往事
桂系是指以李宗仁、白崇禧为首的由广西军人组成的一个军事政治团体，是国民党内除了黄埔系以久最大的一支军政力量。是他们首先促成北伐，让徘徊不前的中国革命终于从起点出发；他们出兵抗日，打下了中外闻名的台儿庄大捷；他们与蒋介石内斗，被蒋介石视作党内最大的劲敌。1949年，他们终于成为中华民国在大陆的最后一朝天子，也是这一年，桂系被打得烟消云散。
第1集：
李宗仁、白崇禧、黄绍竑是桂系早期的三巨头，他们出生在19世纪末期的中国。变乱的时代使少年时代的他们因为不同因缘进入军校，结为知己，从此纵横四海，成就一番惊天动地的事业。
第2集：
北伐结束后，桂系已经拥有两湖两广京津等地，被蒋介石视为心腥大患。在蒋桂战争中，桂系失败，桂系三巨头逃到越南。之后由于蒋介石和汪精卫的矛盾，桂系又得以回到广西，重组力量。这时冯玉祥和阎锡山联手反蒋，桂系也参加进来，开始了蒋冯阎李中原大战，这场大战还是以蒋介石胜利而告终。
第3集：
抗战爆发，蒋桂在民族大义的前提下又携起手来。白崇禧被任命为副参谋总长，李宗仁被任命为第五战区司令长官。抗战初期，国军在淞沪战役中惨败。这时，中日在台儿庄会战，李白两人联手以劣势兵力打败了装备精良的日军，取得台儿庄大捷，蒋桂关系得到了暂时改善。
第4集：
国共内战中国民党的局面越来越不好，蒋介石迫于美国的压力搞民生选举，结果李宗仁宣布参选副总统，蒋介石多方阻挠无效，李宗仁当选。蒋介石气愤之余把白崇禧从中央调出。在之后的淮海战役中，白崇禧拒不接受统一指挥的命令，使国民党军一败涂地。随后，白崇禧又假借和谈逼蒋下野，蒋介石无奈只好同意。
第5集：
1949年1月，三大战役结束，共产党已经占据着长江以北的大部分土地，国民党则据守长江以南，国民党以令人难以想象的速度失去了南中国的半壁江山。李宗仁在他的回忆录里严厉地批评蒋介石到处拆台，唯恐桂系守得住地盘，宁赠朋友不予家奴，终于导致最后的失败。蒋桂之间一边合作一边斗法，终于打掉了手中仅剩的半壁江山，桂系从此烟消云散了。
