《匪巢》讲述“九一八事变”、“七七事变”，中国的领土一步步沦丧在日帝国主义的铁蹄之下。国民党军队日渐后撤，地方军，豪强劣绅大发国难财并加紧压榨百姓。无路可走的山民豹老头和天捣臼被逼上山为盗和绿林朋友在“明抗”、“暗战”，他俩在“招安”“诱杀”和“围剿”中，在奉命入伙的共产党人陈度的影响和引导下，走上了抗日革命的道路。共产党领导的游击队派遣江峰为首的海雁大队，在浙江南部展开游击战，粉碎了日寇的封锁，消灭了柳玉娇为首的海匪：除掉了叛徒，建立了根据地。但由于汉奸告密，日军突然进攻，别动队伤亡惨重，被迫退守深山，转为游击作战，同时队伍内部出现严重分裂……
