《海宝来了2》讲述在浩瀚的宇宙中，玩偶星球正在进行宫殿建设。由于卡塔博士和助手扑通的操控失误，“积木大厦”轰然崩塌，整个玩偶星球都遭到了毁灭性的打击，震动波还殃及到了地球上的彩虹城。为了重建玩偶星球，玩偶大王派出了丑丑和大嘴，企图掠走彩虹城中所有可用的东西……此时，五湖四海最纯净的水奔腾汇聚在一起，诞生了上海世博会吉祥物一海宝。惹人喜爱的海宝与皮皮、贝贝、咕咚和小龙等小伙伴组成了保护彩虹城的“海宝小队”，与丑丑和大嘴展开了一场彩虹城保卫战。想知道海宝如何保卫彩虹城吗？想知道“海宝小队”与丑丑进行了怎样惊心动魄的较量吗？想知道彩虹城最终的命运吗？请跟随海宝一起大喊：海宝来了！
07 空中花园的水枪小队：大嘴发明的“巨型放大镜”使彩虹城四处起火。胡子博士让“海宝小队”用能迅速长出绿色植被的“神奇种子”配合高压水枪拯救彩虹城。
08 彩虹城下雪了：大嘴发明的“彩虹城温度调节器”把整个彩虹城都冰冻了。海宝的潜能被激发，彩虹城的冰冻被化解了。
09 玩偶星球的礼物：海宝和小伙伴们用经过胡子博士改良的“彩虹城垃圾回收系统”将垃圾都转化成了彩虹城的电力资源。玩偶大王的阴谋又一次失败。
10 萤火虫的秘密：大嘴准备用自己发明的“机械发光虫”把萤火虫都抓走。海宝用自己的潜能在萤火虫的帮助下赶走了丑丑。
11 神奇的音符：丑丑利用大嘴发明的“音乐收集器”准备把郎朗弹奏的音乐全部吸走。“海宝小队”组成了彩虹乐队使丑丑诡计失败。
12 彩虹杯足球比赛：丑丑和“海宝小队”展开了争夺“彩虹杯”的足球比赛。“海宝小队”团结一致，默契配合，终于赢得了彩虹杯。
