《天敌》讲述我国某沿海小城渤北，是几家重点军工单位的所在地。历来是境外间谍组织窥伺的目标。
一天，渔船打捞上一个生命垂危的年轻人，在他身上藏着带有我军工机密的电脑芯片。可当年轻人被救醒后，却因为头部遭到剧烈撞击而失去了记忆。
粟丹在调查中发现，年轻人身上的秘密似乎与近期将在渤北进行的导弹试验计划有关。为了引蛇出洞，粟丹在敌人的一次灭口行动中，故意留出口子让年轻人（代号艾迪生）逃走。但侦查员们暗中一直在对艾迪生进行监控和保护。艾迪生为了证明自己的身份，凭着脑海中残存的记忆碎片，开始了一场寻找的旅程。每当艾迪生发现新的线索时就会被人暗中掐断，让他坠入更大的危险之中。一个代号“左手”的神秘间谍组织渐渐浮出水面。
为了获得艾迪生所知道的情报。左手组织中的食指开始对艾迪生进行危险性极高的催眠术。艾迪生回忆起很多过去的事情。艾迪生决定凭借零碎的记忆片段，搞清楚自己的身份，以及整个事件的来龙去脉。
艾迪生正在逐渐接近“左手”组织中的首脑中指。艾迪生明白，只要找到了中指，那一切的事情都能水落石出。艾迪生终于恢复了全疗的记忆。明白一切真相的艾迪生，决定借助自己目前还很含糊的身份重新潜回左手组织。他先利用反间计令左手组织内部产生分化。果然左手内部因为立场的不统一，产生了巨大的分化。最终，他们除掉了中指。此时的艾迪生才发现原来中指并不是左手的首脑，真正的首脑是无名指。通过一系列的任务，艾迪生取得了无名指的信任。最终艾迪生获悉了左手组织要破坏导弹发射的计划。
粟丹带领专家组的人员赶到无名指藏身的地方。准备对他进行最后的围捕。导弹计划如期进行，无名指原本准备干扰导弹试验的电脑病毒失效了。面对赶到现场的侦查员，无名指选择亲手结束自己的生命。
最终粟丹与艾迪生里应外合，将间谍组织一网打尽，保证了导弹试验计划的正常实施。再次铸就了国安战士的荣誉！
