《百变宝贝13：地底的秘密》讲述了两个聪明调皮的小兄弟嘟嘟和哈哈，还有超级可爱的魔法小伙伴——猪娃娃和猫公主，他们为拯救自己的城市——北州市，而和大坏蛋司徒斐、还有司徒斐的手下初一、十五展开了一场场魔法大比拼。可恶的司徒斐总是做一些坏事：把四季调乱、要吃掉美人鱼、教唆外星人攻击北州市、偷吃企鹅蛋……在魔法猫公主小月和猪娃娃的帮助下，聪明调皮的嘟啷和哈哈总是胜利的破坏他们的阴谋，并且把他们折磨得快要疯掉。
第25集 地底的秘密
叔叔告诉小月北州市最近来了个专吃猪的田鼠魔女，希望她多注意猪娃娃的安全。大家都不以为然，可是万万没想到猪娃娃和田鼠打得火热，而且猪娃娃一直处在下风。正当猪娃娃危难的时刻，司徒斐一伙无意中闯进了田鼠魔女的洞穴，田鼠魔女以为是猪娃娃的帮手来了，马上对司徒斐一伙进行攻击，小月他们趁乱救走了猪娃娃，却苦了司徒斐。
第26集 魔法时钟
不知出了什么故障，魔法时钟忽然停止了，并把世间所有的魔力都封印起来，那些使用魔法的人陷入了恐慌，不知道接下来会发生什么事情，但哈哈歪打正着地摆平了这件头痛的事，他居然解开了封印，让一切恢复如初，同时也加深了嘟嘟和哈哈的兄弟之情。但是，魔法恢复后的司徒斐要进行一个更大的阴谋，只有小月的魔法能跟司徒斐对抗了。
