《黑洞》发生在中国一个典型的中等新兴工业城市——天都。天都市龙腾集团董事长、副市长聂大海之子聂明宇是一个全省闻名的青年企业家，但是暗地里，他却操纵着天都市最大的地下黑社会活动。他设立赌场，有计划有预谋地拉拢腐蚀天都市的干部队伍，并利用父亲的市长背景，大肆收买海关各级人员，走私贩私，牟取暴利。他的副手张峰更以为人阴损、手段毒辣著称于世。在这些人的“苦心”经营下，龙腾集团逐渐发展壮大，但很明显这其实是一个不折不扣的、具有黑社会性质的犯罪团伙。
正当聂明宇、张峰等在为自己的光辉“业绩”洋洋得意之时，一封匿名检举信忽然递到了省委组织部。匿名信举报了聂明宇等人的不法行为，引起了省委领导的高度重视，他们责令天都市市委迅速查清此案！然而市委中一些人出于某些不可告人的目的，将聂明宇的义兄，原刑警队长刘振汉调回刑警队主抓此案。而此时，新上任的海关缉私科长贺清明无意间查获了龙腾集团的一批走私车辆，由此龙腾集团的走私黑幕拉开了一角。
刑警队长刘振汉与聂明宇一家有着比血缘还亲的关系，这无疑为刘振汉的侦察工作增加了无形的难度。是要亲情、友情，还是要正义、良知，刘振汉的内心展开了一场激烈的思想斗争。随着案件的展开，一件件命案使得刘振汉一步步认清了聂明宇的庐山真面目。他毅然抛却亲情的纠缠，决绝地投入到追查聂明宇犯罪团伙的侦察工作中去。但侦察工作一开始便遇到了很多阻力：副队长王明发展的暗线被聂明宇的爪牙杀害；刘振汉千方百计获得的人证被人假扮公安截走；刘振汉的儿子突然被人绑架……
而此时此刻，天都市被聂明宇拉拢的各级干部又纷纷向刘振汉暗中施加压力，逼迫他放弃侦察工作。刘振汉的妻子王丽敏被聂明宇招收到公司出任财务总监，聂明宇的妹妹冯蕾蕾此时也从美国回到国内，劝说刘振汉放过聂明宇。更使他想不到的是，在亲情与法律的考验面前，市长聂大海也慢慢从一个廉洁奉公的老党员、老干部逐渐蜕化成一个帮助儿子掩盖犯罪事实，纵容儿子销毁罪证的变节分子，他更纠结天都市的高层领导对市局及刑警队的侦察工作百般发难。
刘振汉本人也在这场斗争中被人诬告投入监牢。但邪不压正，正义的天都市民纷纷出面为刘振汉请命，刑警队的同志在局长的领导下一步也没有放松案件的侦察。老公安局长庞天岳顶住了各方的压力亲赴北京，将案件材料递交给中央。在中央领导的高度关怀下，中纪委、最高人民检察院、公安部和省委部分领导组成联合调查组来到天都市。
最终，这起罕见的走私大案以正义战胜邪恶而结束……
