《仙剑奇侠传3》讲述了渝州城永安当伙计景天梦想成为蜀山大侠，因结识了欢喜冤家唐门大小姐雪见，被卷入唐门和霹雳堂的斗争之中，蜀山派出大弟子徐长卿前往相助。镇守蜀山锁妖塔的千年魔剑被魔尊重楼拔出，锁妖塔被解封，困在剑中千年的龙葵也被释放。原来景天真正身份乃神界的飞蓬将军，因违反神界天规与魔尊决斗而被问罪贬为凡人,重楼把魔剑物归原主是为了与这位强劲的对手再决一战！
群妖祸害人间,只有找到五颗灵珠，才能再次封印锁妖塔，重建六界秩序。景天带着众人踏上寻找五颗灵珠漫漫征程。其间，他们经历了生离死别、爱恨纠葛，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密……伴随着人类与魔妖生死存亡的斗争。最终众人战胜了超越六界的邪剑仙，维护了人间和平。
历炼之后长卿和紫萱选择放下，为大爱牺牲个人的小爱；至于景天，他的选择会是什么，他将何去何从？是恢复神将的身份还是留在人间？……
