《密战》讲述了安全局刘志军在抓捕间谍“猎豹”的行动中，发现他要带出境的是“星讯六号”卫星设计方案。保密局接到中央指示，会同安全局、公安局成立专案检查组，组长由保密局督查处处长武梅担任。检查组对卫星研发机构322所展开调查，同时境外间谍也对322所的网络发起攻击，检查组挖出322所的间谍方瑶。但最后时刻方瑶被杀，线索中断。
敌人的第二小组林孝廉同时在滨阳卫星测控实验基地727站下手，他把市委秘书长佟一凡拉下了水。在佟一凡的帮助下“蝴蝶”进入727站，被滨阳安全局秦风发现，在一场生死较量中，秦风不幸牺牲，“蝴蝶”被击毙。
间谍的行动接连受挫，“银狐”只能孤注一掷对航天十九院发动最后的进攻。一场最后的决战悄然开始。
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