《洛亚奥特曼6：毁灭计划》讲述了基地总管接到任务命令。护送在途中可能发生危险的开发中的研究品到隐秘的处理基地。一行人出发了，不过，把确实非常危险的密封舱中途丢失一个。而那里面是有可怕力量的流星技术。流星技术进入这个被称作“古罗泰斯细胞”的空洞的话会像生物一样行动。然而，因为破坏冲击无法控制非常危险所以必须及时处理。总管在昏厥之前终于憋不住了。对队员们说出了丢失一个密封舱的真相。在总管恳求对其他队员绝对保密后，大家分头开始寻找密封舱。然而流星技术已经起神秘变化了……
01 勇敢地战斗
02 毁灭洛亚·超人的计划（上）
