《漕运码头》讲述道光十九年，圣上为除“三害”，命林则徐赴广州禁烟，两江总督陶澍整顿盐政，又命户部侍郎爱新觉罗铁麟为仓场总督，赴通州漕运码头铲除日益猖撅、积重难返的漕弊。漕运码头上官衙林立，文武交织，三教九流，盘根错节，形成了一个贪污腐败、危机四布、黑幕重重的独立王国。
铁麟乃宗室贵胄，为了不负圣恩，重塑先祖辉煌，他口衔天宪，上任伊始即大刀阔斧地清弊惩奸，以期建功立名。
户部尚书王鼎对铲除漕弊早有准备，几年前就在坐粮厅安插了心腹，并收集了武英殿大学士穆彰阿一手遮天、贪污漕粮巨款的确凿证据。然而，线人黄槐岸的神秘失踪，坐粮厅汉厅丞许良年的阴险歹毒、青帮头目周三爷的呼风唤雨，通州知州夏雨轩的运筹巧计，服侍铁麟的奶妈韩小月的神秘身世以及江湖巫医唐大姑的若隐若现，却将漕运码头搅得雾障迷离，悬疑丛生。
就在铁麟舍身含名力挽沉疴之际，其爱女甘戎及不肖子甘瑞又从黑白两道搅进了漕运码头，从而引发了一系列怪异诡秘乃至人命大案……漕运码头上，一场针锋相对的生死搏杀就此展开。
