《迪迦奥特曼：至急镰仓》讲述了约三千万年以前，在地球遭袭面临大异变之时，一位巨人挺身而出，拯救了人类超古代文明。巨人把自己战斗的躯体隐藏在“迪迦之地”后，化成光离开了地球。
到了2007年，就在地球人类向着永恒的和平不断前进时，一批来自太古的怪兽突然出现在世界各地，破坏安定的人类世界。怪兽再次出现！警报！警报！危机再度袭来！地球危在旦夕！梦想、希望、正义、勇气的超级英雄、怪兽终结者-迪迦奥特曼，最终能否把人类从灭亡的危机中拯救出来呢？
01生命永存：
一艘奇怪的飞船降临地球，带来了一种漂亮的花。三千万年前，古人类就是因为这种花而灭亡的。这种植物的花粉有着可怕的幻觉作用，难道地球人又要难逃灭亡的命运吗？为了拯救人类，大古向人类的软弱展开了挑战！
02至急！镰仓：
摄影师星野在拍江之电电车时，发现了怪兽的踪迹。但是胜利队经过周密的调查，却没有发现怪兽的踪影。就在大家认为星野看走了眼的时候，大古和丽娜相信星野没有看错。他们又一次奔赴现场，就在这时，怪兽出现了……
03告别黑暗：
崛井在约会时，忽然遇到了电力异常事故。胜利队经过调查，发现是细胞被移值后的猴子所造成的。崛井回忆起好友良介的事情，赶紧去宇宙开发局调查。这时，怪兽开始袭击宇宙开发局……就在危急的时刻，胜利队队员和迪迦奥特曼赶到了……
04月球来的逃亡者：
PC的月面基地全军覆灭了，惟一的生存者、副队长岸永逃回地球，指认凶手是月面基地的疾风队长。曾经是疾风战友的居间队长不相信这一指认，提议进行调查。居间队长的提议遭到总监的拒绝……原来，这一切全都是外星人的阴谋。
