《雷欧斯奥特曼》讲述了在与黑暗宇宙大皇帝安培拉星人的激烈决斗结束之后，为将已恢复平静的地球夺到手，怪兽们再度开始了新一轮的猛烈攻击！“地球要由奥特曼的力量来拼死守护！”凤源在心中发誓，要带领MAC与其决一死战。然而在那场战斗中，他被吸入了一个奇怪的未知空间。就在那里出现了黑色巨人袭击了凤源！袭击凤源的黑色巨人，正是使用了安培拉星人遗留下的能发挥强大魔力的铠甲。此时，凤源变身雷欧斯！地球的再次异变，原因也是铠甲的力量造成的。如果再对暴走的暗黑铠甲放之不管的话，不仅对地球，对整个宇宙都会带来暴风雨般的破坏。雷欧斯和MAC再次合力挑战强敌。结果他们，能否破坏恶魔之铠，夺回宇宙的和平呢？
