《施公奇案》讲述了江都县知县施世纶（欧阳震华）一次审案时出错，令无辜者上吊自杀。纶从此信心尽失，意志消沉。后纶无意中得到一个梦枕，从此每当他有想不通的案件时，枕神（卢海鹏）便会出现在他的梦境中，以谜题向他暗示破案的关键。
纶因有枕神的相助而成功捉拿一桩案件的真凶，同时救了欢喜冤家米香蓉（郭可盈），令蓉对他改观。巧合的是，蓉自此一次又一次牵涉入纶审理的奇案中，甚至因他而入狱！
纶其后终于发现枕神的真正身分，亦发现枕神多番相助，原来是为了要训练自己的推理能力，从而帮助枕神翻案。而这宗灭门惨案，竟与蓉大有关连。
