《憨八龟的故事第二部拯救王子9丛林危机》讲述了鹰教授从遥远的星系取得具有吞噬能量能力的阿尔法原虫，然后通过DNA重组制成了可怕的武器，准备一举消灭掉憨八龟和他的垃圾拯救队。此刻，垃圾拯救队正在丛林跋涉，他们面对的是蚊虫、鳄鱼、吸血蝙蝠和食人鱼等一系列困难。还有更大的潜在威胁，当然是来自井上雄的追杀。大精精和小小怪侦察到憨八龟的具体行踪，回基地报告的时候不小心在阿尔法原虫中加入了自己的DNA，成为了阿尔法原虫的唯一弱点。井上雄对阿尔法原虫信心满满，亲自坐飞船来到丛林观战。一场艰苦的战斗终于以垃圾拯救队的胜利告终，等待着他们的将是更残酷的旅程。
第三十三集 丛林危机
第三十四集 原虫的弱点
第三十五集 胜利！胜利！
第三十六集 邂逅西夏王子
