《最后决战》讲述20世纪一个冬天。秘密回国参加我新型潜艇研究制造的华裔专家，在途经香港时遭到台湾特务的追杀，险些丧命。
北京的反间谍局立即分析情况，作出我内部存在台湾间谍的判断，并迅速展开调查。本以等待退休的许子风和年轻的反间谍局人员骆战，以及原在香港的外派人员蓝美琴组成三人小组，接受了此项任务。
为了敲山震虎，许子风一面要求与但戈然再次见面，一面放出口风，声称此次见面的目的在于揭穿但戈然假叛逃的伎俩。果然，但戈然应约到达香港后便被台湾方面的枪手击毙。但戈然的死亡，既证实了其假投诚是一个圈套，也使许子风他们将内部间谍的最大嫌疑集中在了研究所保卫处负责人范仕成身上。
在这场隐秘而曲折的严酷斗争中，许子风的前妻李景走出了多年的心理阴影；他们的女儿许婉云与潜伏进来的特务陆一夫经历了一场危险而伤感的恋爱；骆战在斗争中逐步成熟；蓝美琴以她的聪慧睿智推动着三人小组的工作，并与骆战产生了爱情；许子风更是经受了巨大的困境，在国家安全和个人情感两者之间进行着艰难的抉择。当最终的胜利来临时，许子风一家三口重新恢复了和睦与温情，而蓝美琴却在除夕前夜接受了新的任务，不辞而别地远走他乡，这给骆战留下了深深的惆怅。
但是，他们心里都十分清楚，作为一个国家安全的保卫者，祖国的利益永远是第一位的。个人的命运与情感，必须无条件的服从于那个崇高而隐秘的使命。因为他们将用一生来履行那个内心深处的忠诚誓言。
