《决死特务连》讲述了民国早期，蒋介石和李宗仁是两大死对头，但后来由于形势发展需要，他们走向联合，在国共内越后期，李宗仁被蒋介石推上代总统的宝座，成了蒋介石的挡箭牌。1949年4月，国共和谈破裂。4月21日中国人民解放军发动渡江战役，势如破竹，国军溃不成军，代总统李宗仁不甘再做蒋介石的挡箭牌，回到广西决定重整桂系军队，割据一方。该剧讲述的就是这个时期国民党中统局特务与桂系之间的一场内部战争。中国人民解放军横渡长江之后，蒋介石深知大势已去，但还是决定退守大西南山区，做最后一搏。与此同时，蒋介秘密安排了一支决死特务连空降到桂系控制区，一是要监视李宗仁部的动向，二是要与中共地下党员争夺一批清朝宝藏。桂系特务在得知这一绝密情报之后，开始与中统局暗中对抗，希望能够争夺到这批宝藏，充实桂系实力。殊不知，中共的王牌侦查员就潜伏在决死特务连中，他的任务是激化中统局与桂系特务的矛盾，促使他们互相残杀，并最终获得宝藏的真实下落。在一次关键的行动中，决死特务连与桂系特务发生激烈火拼，混战中双方死伤惨重，存活下来的人失去联系，相互不知对方死活，宝藏的线索也全部中断。1949年1219桂系大本营解放，中统局通过地下电台重新组织决死特务连成员继续追查宝藏，并对解放区的重要工业设施实行破坏，桂系的残余骨干也希望争夺到这批财宝。此时，还没暴露身份的中共王牌侦察员，按照上级指示继续潜伏，要在时期成熟的时候将这帮特务和反动派一网打尽。一场神秘诡异的戡争即将爆发。
