《急电小信使6》故事主要围绕小信使新人卡噗嗒的送信经历展开,在繁忙的送信工作中,他遇到了种种困难:有来自外界的麻烦,诱惑,也有他自身的烦恼、困扰。在不断克服困难,努力帮助周围朋友的过程中,卡噗嗒找到了送信的意义,他还用自己的言行感染了其他的信使。他的热情和真诚终于打动了工场里一颗颗冷漠已久的心,最终,整个工场又找回了失落已久的温暖和谐。
第三十一集：越狱：乌龙博士的电爆源有了进展，皮纳在索艾尔和星兄弟身上做实验，星兄弟变得沉默，索艾尔却变得异常活泼，到处破坏。皮纳又命令乌龙博士把卡噗嗒的电爆源能量调至最大，乌龙博士拒绝了。一直担忧众人的海贝也忍不住来到工地寻找大家。
第三十二集：英雄海贝：海贝无意中救了乌龙博士，特警们也赶来工地，救下了众人。阿特和皮纳挟持了索艾尔，带着电爆源慌忙逃命。卡噗嗒为了找回索艾尔，找上了无所不能的西门吹。
第三十三集：疯狂的索艾尔：西门吹找到了索艾尔，卡噗嗒正要将自己的电磁源给他，西门吹却拒绝了，让大家不禁对他刮目相看。乌龙博士为卡噗嗒等换上了新的电磁源，这正是为了对付的阿特的电爆源而准备的。
第三十四集：阿特的反击：整天疲于逃命的阿特和皮纳忍无可忍，将电爆源装在自己身上，决定回到工场去报复卡噗嗒，他们很快潜入乌龙博士的实验室，并骗出了中央处理系统的通行口令。
第三十五集：阿特帝国：阿特掌握了整个信使世界，并惩罚了背叛他的皮纳。当他发现卡噗嗒等人还不在他控制之内时，他决定亲自报复他们。
第三十六集：最终对决：卡噗嗒等与阿特进行最终对决，特警受到阿特的控制，信使们落在了下风，但关键时刻，大家发现阿特也患有“先天性液体过敏症”，最后是索艾尔用一杯洒翻在地上的水，击败了阿特。信使工厂再次恢复平静，信使们比以前更加友爱团结。
