《马店》讲述了一个非常传奇的故事，它以震惊中外的“马加理事件”为主线，讲述了两个家族的恩怨情仇，展示了处于封建社会末期的中国商人在大时代中的命运。闵家和南洋货栈竺家前人世交甚深，后人却因商道不同，终归分道扬镳。闵家为了保住货栈，天和马店老掌柜闵寿楠和竺自臻为儿女订下换亲之约。闵芸儿却在出嫁前逃婚出走，并随所爱之人寸鹏赶起了马帮。行至中缅边境，恰好与英国马加里探路队遭遇，马帮杀死了马加里及其同伙，制造了轰动一时的“马加里事件”。二少爷闵华洲，为缓解两家恩怨，替妹妹承诺情债，娶了竺自臻的瘫女竺玉秋。老掌柜闵寿楠经不起双重打击，临终前将振兴闵家和化解两家危机的使命托付给了大儿媳竺晚秋，并对其合盘说出两家恩怨情仇……
中法战争爆发，闵华洲投靠黑旗军首领刘永福，奔赴了抗法战场，并在战场上壮烈“殉国”。其妻竺玉秋得知，自残身亡。闵芸儿因此更加痛恨洋人，也就越发怀恨竺家。为了走经世致用之路，竺自臻支持法国人修筑“滇越铁路”，接连意想不到的事情随着而来，国仇，家恨与经营危机，徘徊在传统与图新，治家与治国，守道与叛道之间的他们又将如何抉择，何去何从？两家人，几代人的恩恩怨怨，又将如何化解，能否泯然释怀？
