《神奇宝贝宠物小精灵危险的迷宫篇2》讲述小智为了要成为一流的小魔怪指导员，而必须踏上修行的旅程接受考验，不料出发的当天，小智却因睡懒觉而误了时间，比其它人晚了一步。好不容易从博士那里领来没有要的“皮卡丘”，谁知“皮卡丘”却难以照料又特别固执。
01 挖这里，小山猪，寻找温泉
02 急冻鸟VS胖丁，暴风雪之中
03 风速狗与火炎之石
04 土龙弟弟全都没了
05 大嘴蝠对抗假面女王武藏遗迹之战斗
06 图图犬的奇迹旭日中的光辉
07 尼多力诺与尼多娜-小刚的玫瑰色生活
08 再见了菊草叶，电气的迷宫
09 月桂叶到哪里去了在药草圆抓住它
10 天然雀的占卜预测未来的神秘
